1958年3月，为了发展中医事业和解决北京中医学院临床教学基地问题，经卫生部批准，开始创建医院，当时院址在北新仓18号，条件较为简陋，占地面积为5500平方米。医院始称为“北京中医学院东直门医院”。1958年7月14日正式开诊，9月收治病人，当时有床位120张，职工180人，其中医务人员106人。设内、外、骨、妇、儿、针灸6个临床科室及药房、检验、放射3个医技科室。日均门诊量400人。