北京中医药大学东直门医院脑病中心的前身脑病科是在全国中医系统内率先成立的脑病专业科室（神经内科），在董建华院士、王永炎院士等著名中医临床大家的带领下，经过几代人的努力形成了较为系统完整的中医脑病诊疗体系和学科团队。作为国家中医药管理局全国脑病急症协作组组长单位、国家中医药管理局中医脑病重点学科和重点专科建设单位、国家中医药管理局中医脑病重点专科协作组组长单位、国家中医药管理局高水平中医药重点学科、重大疑难疾病中西医临床协作试点单位、国家高级卒中中心建设单位及中华中医药学会内科分会主任委员单位等，同时拥有国家中医临床研究基地、国家中医药管理局脑病中医证治重点研究室等平台优势，拥有覆盖全国的专科协作网络、科研协作网络及专家协作网络，与国内外知名院校和学术机构建立了长期稳定的协作关系，目前在中医脑病领域的临床、科研与教学方面居国内前沿。
脑病科一区
脑病科二区
脑病科三区
脑病科四区
脑病科五区
脑病科六区
神经外科东城院区
神经外科通州院区
脑功能室东城院区
脑病中心目前有6个脑内科（神经内科）病区、2个脑外科（神经外科）病区、1个康复科，医护人员249人，开放床位238张。拥有中国工程院院士2人、岐黄学者1人、全国优秀中医临床人才1人、首都名中医1人、首都中青年名中医1人、首都十大健康卫士1人、北京市群众喜爱的中青年名中医1人，北京市百名优秀青年医师1人等。开设了中风病防治一体化门诊、中风病康复门诊、神经介入门诊及神经系统常见病（失眠、抑郁与焦虑、痴呆、眩晕、头痛）、疑难病（癫痫、多发性硬化、帕金森病、运动神经元病、重症肌无力）等特色专科门诊。设有脑电图室、肌电图室、TCD室、神经心理测查室、重症监护病房和康复室等。拥有舌脉象仪、多通道生物信息采集分析系统、经颅多普勒血流分析系统、吞咽言语治疗仪、智能通络治疗仪、半导体激光治疗仪、经颅磁刺激治疗仪等专科设备，创建了中风后肩手综合征综合康复疗法、偏头痛的中药熏蒸热敷疗法、中风后吞咽障碍的中医综合康复疗法等特色疗法。充分发挥中西结合、内外结合的优势，不断提高中医药与现代医学诊疗水平，为广大患者提供全面优质的诊疗服务，得到了广泛肯定与一致好评。
脑病中心十分重视科研与教学工作，拥有临床专业博士生导师11人，硕士生导师17人，建有博士后流动站，已培养博士研究生数十名，硕士研究生百余人。作为优秀的脑病创新团队，连续承担国家“七五”、“八五” “九五”、“十五”科技攻关课题及国家自然科学基金、“863”、“973”、“十一五”、“十二五”支撑计划、“十三五”重点研发计划、十四五”重点研发计划等多项省部级以上课题。先后获得国家级、省部级科技成果奖20余项，发表论文300余篇，发明专利10余项。承担进修医师的培训任务，为全国培养了大量从事脑病研究的学术骨干。举办了多次全国性脑病学术研讨会，学术影响涉及港澳台等广大地区，并派专家赴美国、德国、日本、新加坡等国家讲学、工作、学习，取得了很好的国际影响。参与国家中医药标准化工作，承担了国家卫健委、国家药监局、国家中医药管理局、中华中医药学会及世界卫生组织（WHO）相关指南、规范、原则制修订工作，为促进中医药标准化进程、推动中医药走向世界做出了突出贡献。